40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1698 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1698  tolA protein  100 
 
 		 356 aa  701    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  99.44 
 
 		 356 aa  695    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  89.89 
 
 		 356 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  54.12 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  53.22 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  47.22 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  46.15 
 
 		 379 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  44.53 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  34.25 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  43.81 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  30.25 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  27.68 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  27.63 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  40.59 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  27.7 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  32.14 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  36.78 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  36.84 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  37 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  34.38 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  31.75 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  29.08 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  32.82 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  32 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  24.2 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  30.77 
 
 		 471 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  30.77 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0214  hypothetical protein  27.19 
 
 		 189 aa  55.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.220616  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  33.64 
 
 		 484 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2417  putative TolA  31.13 
 
 		 271 aa  52.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  58 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1680  hypothetical protein  27.45 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  36.11 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  33.33 
 
 		 489 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3613  hypothetical protein  28.28 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4788  hypothetical protein  25.96 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1901  hypothetical protein  26.73 
 
 		 284 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0329  hypothetical protein  31.52 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  27.47 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>