17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1016 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  558  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.751843  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  74.63 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0329  hypothetical protein  34.78 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  37.8 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  35.65 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  34.51 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  35.65 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  30.12 
 
 		 436 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  32.67 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  32.74 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  34.23 
 
 		 464 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  28.11 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.13 
 
 		 2449 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  32.38 
 
 		 2179 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.68 
 
 		 2272 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  29.44 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  25.88 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>