33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4435 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  100 
 
 		 472 aa  874    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  91.28 
 
 		 464 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  76 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  75 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  72 
 
 		 471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  72 
 
 		 471 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  33.64 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  35.02 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  37.29 
 
 		 277 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  30.07 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  28.37 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  26.95 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  34.92 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  33.76 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  29.81 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  34.78 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  30.14 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  39.69 
 
 		 524 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  34.78 
 
 		 356 aa  55.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  34.78 
 
 		 356 aa  54.7  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  36.92 
 
 		 570 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  50.32 
 
 		 575 aa  53.5  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.751843  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  31.62 
 
 		 368 aa  50.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  51.06 
 
 		 488 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  27.87 
 
 		 325 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  33.47 
 
 		 2196 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  51.52 
 
 		 548 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  42.67 
 
 		 718 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  33.33 
 
 		 314 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.77 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  57 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  28.57 
 
 		 5185 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>