24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0745 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  100 
 
 		 450 aa  848    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  82.12 
 
 		 458 aa  275  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  74.83 
 
 		 471 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  74.83 
 
 		 471 aa  249  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  74.66 
 
 		 464 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  74.66 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  32.66 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  38.3 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  29.08 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  39.13 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  29.79 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  28.57 
 
 		 317 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  30.14 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  36.21 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  29.45 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  36.21 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  31.51 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1016  hypothetical protein  32.38 
 
 		 293 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.751843  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  32.97 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  33.02 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  29.9 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  27.88 
 
 		 270 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1680  hypothetical protein  32.58 
 
 		 281 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  29.17 
 
 		 314 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>