22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3620 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  758    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  55.9 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  49.88 
 
 		 379 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  50.25 
 
 		 381 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  48.08 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  48.08 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  47.31 
 
 		 356 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  42.16 
 
 		 351 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  30.51 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  43.3 
 
 		 148 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  26.14 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  30.43 
 
 		 497 aa  76.3  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  33.56 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  32.55 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  28.78 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  36 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  29.92 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  29.27 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  27.94 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  26.25 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  28.67 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  32.08 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>