24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0921 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  100 
 
 		 394 aa  777    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  50.97 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  40.3 
 
 		 464 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  38.51 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  37.98 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  37.67 
 
 		 450 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  39.55 
 
 		 472 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  28.94 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  30.52 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  33.85 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  29.9 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  28.75 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  33.58 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  34.33 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  28.29 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  27.09 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  24.03 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  27.34 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.95 
 
 		 2449 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  35.11 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  26.67 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  30.21 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  34.69 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  25.65 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>