24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1310 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  100 
 
 		 327 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  85.93 
 
 		 325 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  90.62 
 
 		 320 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  71.04 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  51.89 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  75.89 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  48.01 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  33.85 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  31.79 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  31.14 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  33.33 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  27.17 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  28.08 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  36.17 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2417  putative TolA  35.42 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  28.57 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  29.79 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  25.59 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  32.97 
 
 		 472 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  30.51 
 
 		 471 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  25 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  30.51 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  28.81 
 
 		 458 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>