22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3202 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  91.08 
 
 		 379 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  100 
 
 		 381 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  53.81 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  49.14 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  43.31 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  43.98 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  43.98 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  37.69 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  39.29 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  27.27 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  26.79 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  27.02 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  25.91 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  30.08 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  30.95 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  29.96 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  27.7 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  27.37 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  32.43 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  28.39 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  34.15 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  26.34 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>