20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2323 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  777    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  99.04 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  83.89 
 
 		 416 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  40.32 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  67.59 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  56.31 
 
 		 514 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  32.42 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  37.4 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0818  hypothetical protein  50.79 
 
 		 147 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0544708  hitchhiker  0.00523274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  35.71 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0973  hypothetical protein  40.43 
 
 		 171 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0416255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  30 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.27 
 
 		 2449 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  31.33 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  28.78 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  28.57 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.08 
 
 		 1888 aa  51.6  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0974  hypothetical protein  26.67 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0162438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  38.83 
 
 		 489 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>