20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0685 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  100 
 
 		 514 aa  961    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  50 
 
 		 416 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  47.25 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  46.99 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  60 
 
 		 393 aa  141  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  46.26 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  57.43 
 
 		 351 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  37.21 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  33.97 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  31.87 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  33.97 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0973  hypothetical protein  39.08 
 
 		 171 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0416255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  30.37 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0544708  hitchhiker  0.00523274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  31.63 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  43.26 
 
 		 996 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  34.17 
 
 		 317 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.42 
 
 		 561 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  32.18 
 
 		 293 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  50 
 
 		 318 aa  43.5  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>