30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3497 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  100 
 
 		 379 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  91.08 
 
 		 381 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  54.88 
 
 		 356 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  48.64 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  44.71 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  46.7 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  46.72 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  39.43 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  42.73 
 
 		 148 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  28.39 
 
 		 314 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  27.2 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  30.86 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  26.52 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  27.2 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  29.17 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  31.86 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  26.17 
 
 		 472 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  29.09 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  31.19 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  29.24 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  30.53 
 
 		 458 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1680  hypothetical protein  32.39 
 
 		 281 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4428  hypothetical protein  31.07 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  35.29 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1093  hypothetical protein  25.25 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0214  hypothetical protein  26.09 
 
 		 189 aa  43.9  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1901  hypothetical protein  33.82 
 
 		 284 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  26.86 
 
 		 292 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3613  hypothetical protein  29.58 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>