43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1217 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  100 
 
 		 356 aa  699    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  89.33 
 
 		 356 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  89.89 
 
 		 356 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  52.47 
 
 		 356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  51.82 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  45.75 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  43.81 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  53.3 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  33.89 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  47.06 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  29.32 
 
 		 394 aa  92.8  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  27.37 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  41.58 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  26.06 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  35.58 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  33.2 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  35.96 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  22.91 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  25.7 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  34.13 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  35.92 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  34 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  33.59 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  28.1 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  31.54 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  31.54 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  34.06 
 
 		 489 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  27.69 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  34.22 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0214  hypothetical protein  27.19 
 
 		 189 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.220616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2417  putative TolA  31.13 
 
 		 271 aa  53.1  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  25.92 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  60 
 
 		 444 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  42.42 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  28.9 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3613  hypothetical protein  28.28 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0329  hypothetical protein  33.7 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  27.47 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4461  hypothetical protein  35.82 
 
 		 161 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5031  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.690485  normal  0.0460153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4571  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  35.2 
 
 		 423 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>