20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4461 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4461  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5191  hypothetical protein  76.87 
 
 
162 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4571  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2148  hypothetical protein  56.56 
 
 
165 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324549  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5089  hypothetical protein  51.02 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542031  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5031  hypothetical protein  51.15 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.690485  normal  0.0460153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2600  hypothetical protein  42 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0478945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3769  hypothetical protein  41.05 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2873  hypothetical protein  40.38 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.907366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2872  hypothetical protein  41.35 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2274  hypothetical protein  38.78 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2147  hypothetical protein  42.27 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628865  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0483  hypothetical protein  35.48 
 
 
122 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1768  hypothetical protein  35.23 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0351  hypothetical protein  36.56 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.108998  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3811  hypothetical protein  34.04 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3359  hypothetical protein  34.69 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0228  hypothetical protein  33.67 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0439  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  35.82 
 
 
356 aa  47.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>