20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4571 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4571  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  290  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5031  hypothetical protein  99.32 
 
 		 148 aa  286  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.690485  normal  0.0460153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5089  hypothetical protein  85.03 
 
 		 158 aa  241  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2148  hypothetical protein  55.86 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5191  hypothetical protein  51.45 
 
 		 162 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4461  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2600  hypothetical protein  41.35 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2873  hypothetical protein  39.45 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.907366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2872  hypothetical protein  41 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3769  hypothetical protein  32.37 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2274  hypothetical protein  34 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1768  hypothetical protein  39.39 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0483  hypothetical protein  33.02 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3811  hypothetical protein  33.6 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0439  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3359  hypothetical protein  31.2 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0228  hypothetical protein  31.2 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0351  hypothetical protein  31.07 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.108998  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2147  hypothetical protein  33.64 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.628865  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  27.5 
 
 		 356 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>