23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5303 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  100 
 
 		 458 aa  859    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  84.53 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  84.75 
 
 		 471 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  82.55 
 
 		 450 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  73.29 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  76.03 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  31.35 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  28.31 
 
 		 436 aa  130  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  30.25 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  32.73 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  30.25 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1016  hypothetical protein  34.29 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.751843  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  34.04 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  28.03 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  35.59 
 
 		 356 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  31.45 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  35.59 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  35.59 
 
 		 356 aa  53.9  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  33.02 
 
 		 368 aa  53.5  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  31.18 
 
 		 325 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  30.11 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  35.67 
 
 		 575 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  37.23 
 
 		 2196 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>