26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0271 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  100 
 
 		 436 aa  871    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  51.46 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  38.52 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  38.3 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  39.68 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  39.68 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  39.26 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  25.71 
 
 		 314 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  30.94 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  27.82 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  24.28 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  31.58 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  28.28 
 
 		 314 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  30.41 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  29.08 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  30.08 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  27.52 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  28.57 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  26.83 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  37.23 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  29.22 
 
 		 356 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  28.65 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  25.69 
 
 		 270 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  34.67 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1016  hypothetical protein  32.11 
 
 		 293 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.751843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  23.86 
 
 		 2327 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>