35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2718 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  683    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  67.34 
 
 		 314 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  55.91 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  75.89 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  74.47 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  37.54 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  51.08 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  32.87 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  29.47 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  26.5 
 
 		 436 aa  90.1  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  28.57 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2417  putative TolA  34.29 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  35.11 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  30.72 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  25.64 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  28.77 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  29.46 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  24.81 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  27.56 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  29.17 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  27.56 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  44.79 
 
 		 570 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  45.56 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  38.55 
 
 		 524 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  24.15 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  24.73 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  27.1 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  43.12 
 
 		 548 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  39.26 
 
 		 926 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  46.75 
 
 		 524 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  31.73 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  57.3 
 
 		 575 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  37.74 
 
 		 5185 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  37.04 
 
 		 440 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  37.04 
 
 		 440 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>