29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6882 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  100 
 
 		 336 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  50.31 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  49.69 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  45.23 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  56.85 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  56.38 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  51.08 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  31.79 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  31.46 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  32.93 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  30.11 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  31.82 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  30.71 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  28.73 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  27.08 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  30 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  30.51 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  28.81 
 
 		 471 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  28.81 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  29.44 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  29.44 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2417  putative TolA  31.48 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  27.23 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  29.67 
 
 		 472 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  25.9 
 
 		 1088 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  26.46 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  31.07 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  34.85 
 
 		 1678 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>