29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4752 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  100 
 
 		 314 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  54.81 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  44.04 
 
 		 336 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  48.47 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  35.67 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  66.02 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  34.89 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  59.34 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  30.43 
 
 		 356 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  32.76 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  29.26 
 
 		 394 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  38.19 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  29.91 
 
 		 356 aa  92.4  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  26.87 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  30.77 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  27.13 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  28.21 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  26.38 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  33.01 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3245  hypothetical protein  33.68 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  33.33 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  31.91 
 
 		 464 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  28.16 
 
 		 148 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  26.17 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3613  hypothetical protein  27.34 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4788  hypothetical protein  28.44 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  31.78 
 
 		 383 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  33.33 
 
 		 458 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  29.81 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>