28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3057 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  100 
 
 		 317 aa  634    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  35.62 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  34.17 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  29.22 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  29.38 
 
 		 351 aa  92.8  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  29.05 
 
 		 356 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  25.07 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  26.86 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  30.28 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  25.78 
 
 		 436 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  26.46 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  45.16 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  24.19 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  46.46 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  26.95 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  30.92 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  46.43 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  29.81 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  28.37 
 
 		 450 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  29.59 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  25.73 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  31.96 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  28.37 
 
 		 458 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  26.95 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  30.33 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  25.98 
 
 		 471 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  25.98 
 
 		 471 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2417  putative TolA  25.23 
 
 		 271 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>