26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3388 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3388  protein TolA  100 
 
 		 464 aa  849    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  91.28 
 
 		 472 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  73.33 
 
 		 458 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  75 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  71.33 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  71.33 
 
 		 471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  34.56 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  34.5 
 
 		 394 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  30.5 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  31.21 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  38.89 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  37.17 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  26.95 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  33.33 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  30.77 
 
 		 270 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  32.91 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  28.97 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  32.91 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  31.25 
 
 		 320 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1016  hypothetical protein  33.94 
 
 		 293 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.751843  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  27.18 
 
 		 325 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  32.28 
 
 		 2196 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  49.35 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  30.56 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  27.95 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  25.14 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>