30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5228 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  100 
 
 		 471 aa  890    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  99.15 
 
 		 471 aa  882    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  71.23 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  85.04 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  71.92 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  31.62 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  63.48 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  25.44 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  29.63 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1016  hypothetical protein  34.75 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.751843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  27.22 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  28.81 
 
 		 350 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  30.91 
 
 		 270 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  34.19 
 
 		 368 aa  54.7  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  30.08 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  40.14 
 
 		 926 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  33.33 
 
 		 356 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  31.82 
 
 		 351 aa  50.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  29.27 
 
 		 325 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  33.33 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  32.03 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  28.23 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  33.33 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  38.29 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  25 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  37.63 
 
 		 575 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  37.77 
 
 		 718 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  38.01 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  52.54 
 
 		 570 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  40.1 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>