39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2121 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  31.04 
 
 		 356 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  28.24 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  34.48 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  34.29 
 
 		 314 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  28.69 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  27.78 
 
 		 314 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  32.75 
 
 		 356 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  33.71 
 
 		 356 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  27.71 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  31.28 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  32.57 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  33.73 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  33.93 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  28.76 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  30.34 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  28.85 
 
 		 436 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  29.79 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  30.93 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  34.29 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  36.73 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  34.58 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  30.87 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  29.94 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.49 
 
 		 2449 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  35.05 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4788  hypothetical protein  24.61 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  31.15 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0214  hypothetical protein  27.84 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.220616  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3613  hypothetical protein  26.82 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  32.04 
 
 		 471 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  32.99 
 
 		 458 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  32.04 
 
 		 471 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 393 aa  52.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  28 
 
 		 383 aa  52  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  30.93 
 
 		 450 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1680  hypothetical protein  25.17 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  26.21 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0943  adhesion exoprotein  24.64 
 
 		 979 aa  42.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>