22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3245 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3245  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  39.72 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1680  hypothetical protein  44.8 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3613  hypothetical protein  43.58 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1901  hypothetical protein  60 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4788  hypothetical protein  34.08 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  33.02 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  23.86 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  29.55 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  27.9 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.25 
 
 		 2449 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  26.17 
 
 		 1888 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  25.93 
 
 		 2179 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  30.7 
 
 		 3472 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  25.23 
 
 		 2272 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  24.79 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  30.7 
 
 		 3471 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  25.23 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  24.32 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  29.03 
 
 		 472 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  31.86 
 
 		 3521 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  26.96 
 
 		 464 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>