55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3548 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  100 
 
 		 2327 aa  4501    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  30.69 
 
 		 2016 aa  595  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  28.41 
 
 		 2487 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  27.3 
 
 		 2252 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1411 aa  362  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  27.6 
 
 		 2665 aa  343  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  26.91 
 
 		 2797 aa  339  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  24.99 
 
 		 2025 aa  335  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  28.46 
 
 		 2955 aa  331  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  26.55 
 
 		 2797 aa  331  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1981 aa  327  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1993 aa  315  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  30.2 
 
 		 2115 aa  306  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  25.33 
 
 		 2331 aa  298  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1587 aa  289  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1799 aa  288  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1652 aa  276  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  26.66 
 
 		 1582 aa  274  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1874 aa  274  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1557 aa  274  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1850 aa  269  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  26.59 
 
 		 2335 aa  265  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  25.82 
 
 		 2052 aa  258  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  35.81 
 
 		 3296 aa  244  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  20 
 
 		 1543 aa  172  6e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  30.07 
 
 		 764 aa  111  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  17.77 
 
 		 7659 aa  70.1  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.51 
 
 		 1235 aa  59.7  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  26.55 
 
 		 787 aa  52.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.61 
 
 		 483 aa  51.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  32.67 
 
 		 691 aa  50.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1099 aa  50.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  30.91 
 
 		 810 aa  50.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.83 
 
 		 1153 aa  49.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  30.09 
 
 		 864 aa  49.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  22.75 
 
 		 205 aa  48.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  26.31 
 
 		 745 aa  48.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.93 
 
 		 1226 aa  48.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.57 
 
 		 554 aa  48.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1018 aa  46.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1018 aa  46.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.06 
 
 		 554 aa  46.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.85 
 
 		 568 aa  46.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.16 
 
 		 554 aa  46.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.16 
 
 		 554 aa  46.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.16 
 
 		 554 aa  46.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  27.54 
 
 		 491 aa  46.2  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  27.54 
 
 		 491 aa  46.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  27.54 
 
 		 491 aa  46.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  27.54 
 
 		 491 aa  46.2  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  27.54 
 
 		 491 aa  46.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  27.54 
 
 		 491 aa  46.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  27.54 
 
 		 491 aa  46.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  27.54 
 
 		 491 aa  46.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.73 
 
 		 554 aa  46.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>