19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0972 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 393 aa  742    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  51.29 
 
 		 414 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  53.11 
 
 		 416 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  50.64 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  38.65 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  59.02 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  59.22 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0973  hypothetical protein  46.81 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0416255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  37.04 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  39.81 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  38.89 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0818  hypothetical protein  36.89 
 
 		 147 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0544708  hitchhiker  0.00523274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  31.09 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  33.96 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.32 
 
 		 2449 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  31.87 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  32.32 
 
 		 277 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  22.14 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0974  hypothetical protein  31.11 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0162438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>