19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0670 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  778    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  99.04 
 
 
414 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  82.97 
 
 
416 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  39.77 
 
 
383 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  66.06 
 
 
351 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  55.77 
 
 
514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  36.12 
 
 
351 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  31.72 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  35.43 
 
 
277 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0818  hypothetical protein  49.21 
 
 
147 aa  63.9  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0544708  hitchhiker  0.00523274 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.27 
 
 
2449 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  29.67 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0973  hypothetical protein  38.95 
 
 
171 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0416255  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  30.4 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.08 
 
 
1888 aa  50.8  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  26.96 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  27.94 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0974  hypothetical protein  26.37 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0162438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>