17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0561 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  784    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  85.13 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  84.21 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  41.15 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  63.03 
 
 		 351 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  57.28 
 
 		 514 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  29.77 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0818  hypothetical protein  49.21 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0544708  hitchhiker  0.00523274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0973  hypothetical protein  39.36 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0416255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  32.8 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  30.41 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.22 
 
 		 2449 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.11 
 
 		 1888 aa  61.2  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  26.63 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  26.77 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  25.24 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>