32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4403 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4403  TonB-like  100 
 
 		 359 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1250  Tol-Pal system, TolA  88.81 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  88.06 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3973  tolA protein  85.82 
 
 		 356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0266991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1414  TonB, C-terminal  85.82 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4197  protein TolA  88.72 
 
 		 372 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  93.07 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  58.37 
 
 		 452 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1276  TonB family protein  59.09 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274487  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4537  TolA protein  79.52 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51730  TolA protein  78.31 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000424658  decreased coverage  0.00000451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  44.64 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  30.88 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  32.79 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  28.36 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  28.01 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  36.26 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  42.5 
 
 		 2196 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0053  hypothetical protein  46.99 
 
 		 285 aa  53.5  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0301196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1195  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1331  hypothetical protein  59.02 
 
 		 247 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  35.44 
 
 		 271 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  35.44 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  28.88 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  56.14 
 
 		 914 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  29.35 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  22.8 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  22.53 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4013  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012412  hitchhiker  0.000000000204146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  26.35 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  29.39 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  29.17 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>