14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0613 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0613  TonB-like  100 
 
 		 286 aa  568  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.543734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2162  transcriptional regulator, Fis family  39.37 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.111868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0858  Fis family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 298 aa  148  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.487763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0746  TonB family protein  37.58 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000019388  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1909  hypothetical protein  34.95 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0749  transcriptional regulator, Fis family  33.89 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0027337  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1712  hypothetical protein  32.35 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0852036  hitchhiker  0.00264543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  26.73 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  24.56 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  27.09 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  25.89 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0204  TonB family protein  24.46 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000615239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1146  TonB family protein  37.97 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  29.85 
 
 		 342 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>