23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3227 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3278  hypothetical protein  72.26 
 
 		 966 aa  966    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0705  conserved repeat domain protein  57.25 
 
 		 847 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.63202e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  100 
 
 		 996 aa  1954    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0694  conserved repeat domain protein  56.71 
 
 		 848 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0143238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0366  chromosome segregation ATPase-like protein  61.32 
 
 		 1030 aa  763    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.641713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0581  conserved repeat domain protein  46.68 
 
 		 880 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1012  hypothetical protein  38.89 
 
 		 432 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.47 
 
 		 643 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0936  hypothetical protein  47.87 
 
 		 801 aa  91.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  34.33 
 
 		 848 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.95 
 
 		 561 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.12 
 
 		 453 aa  70.5  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.33 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  44.52 
 
 		 510 aa  64.3  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.45 
 
 		 482 aa  55.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2719  conserved repeat domain protein  29.55 
 
 		 435 aa  52.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  33.9 
 
 		 334 aa  48.5  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  27.31 
 
 		 2821 aa  46.2  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  32.69 
 
 		 318 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0831  hypothetical protein  36.27 
 
 		 690 aa  46.2  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.608247  normal  0.0708988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  31.41 
 
 		 9529 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 302 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1354  Sporulation domain protein  27.27 
 
 		 409 aa  44.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89794e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>