92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1829 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  86.75 
 
 		 415 aa  755    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  92.77 
 
 		 415 aa  797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  88.22 
 
 		 414 aa  752    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  86.99 
 
 		 415 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 415 aa  847    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  87.23 
 
 		 415 aa  758    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  87.95 
 
 		 414 aa  756    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  78.31 
 
 		 415 aa  679    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  93.01 
 
 		 415 aa  800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  74.46 
 
 		 415 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  93.25 
 
 		 415 aa  801    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  72.25 
 
 		 415 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  71.46 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  72.2 
 
 		 419 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  67.47 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  70.15 
 
 		 416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  42.23 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  42.17 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  41.57 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  31.15 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  30.67 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  26.7 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  30.35 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  24.48 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  26.47 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  27.7 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  27.78 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  24.45 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  26.51 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  21.48 
 
 		 510 aa  73.2  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  23.16 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  24.26 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  25.56 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  21.05 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  24.06 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  31.65 
 
 		 223 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 878 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  24.01 
 
 		 1040 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 602 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1094 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 344 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.69 
 
 		 676 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 3035 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.17 
 
 		 573 aa  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 4489 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 3560 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 610 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 883 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.36 
 
 		 833 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 		 758 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 		 1288 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 214 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 329 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.87 
 
 		 810 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 		 2240 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 		 610 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 465 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.8 
 
 		 707 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  21.1 
 
 		 992 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  22.22 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  25.43 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  22.36 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  22.22 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  22.22 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  22.16 
 
 		 955 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 750 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.73 
 
 		 3301 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 632 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  24.53 
 
 		 594 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 		 1186 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2819  hypothetical protein  27.74 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70664  hitchhiker  0.00000273831 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  29.14 
 
 		 929 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 		 564 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 1297 aa  43.9  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 4079 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 		 572 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.02 
 
 		 1056 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 534 aa  43.1  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 711 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>