21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1620 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  753    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  22.8 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  20.69 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  20.16 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  19.21 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  18.47 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  18.47 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  18.47 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  19.67 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  19.39 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  19.1 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  19.32 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.68 
 
 		 1694 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  26.38 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 543 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  21.47 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.74 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  20.62 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  19.02 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  25.7 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>