70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1522 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  89.18 
 
 		 415 aa  756    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  78.12 
 
 		 415 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  87.5 
 
 		 415 aa  738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  89.18 
 
 		 415 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  89.18 
 
 		 415 aa  759    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  89.18 
 
 		 415 aa  755    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  88.7 
 
 		 415 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 414 aa  841    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  89.16 
 
 		 414 aa  758    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  88.22 
 
 		 415 aa  752    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  73.56 
 
 		 415 aa  634  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  71.91 
 
 		 419 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  69.95 
 
 		 415 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  70.73 
 
 		 419 aa  585  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  69.71 
 
 		 415 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  70.23 
 
 		 416 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  41.85 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  41.22 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  39.9 
 
 		 423 aa  289  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  30.58 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  31.13 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  29.56 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  24.94 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  27.25 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  24.13 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  24.01 
 
 		 447 aa  96.7  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  26.55 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  25.69 
 
 		 441 aa  89.7  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  23.52 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  21.39 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  24.56 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 883 aa  59.7  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  25.24 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  21.91 
 
 		 492 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 878 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  32.91 
 
 		 223 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 602 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  23.62 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.66 
 
 		 758 aa  49.7  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 3172 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2819  hypothetical protein  28.21 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70664  hitchhiker  0.00000273831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.77 
 
 		 573 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  19.1 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 3035 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 356 aa  47  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.38 
 
 		 676 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  20.31 
 
 		 833 aa  46.6  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.65 
 
 		 564 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 214 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 3560 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  23 
 
 		 992 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.44 
 
 		 2240 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 927 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 621 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.58 
 
 		 810 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 804 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 		 3301 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 4489 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 596 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.93 
 
 		 1040 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1297 aa  43.5  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  28.48 
 
 		 929 aa  43.1  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>