31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0875 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  982    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  43.21 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  20.8 
 
 		 407 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  25.35 
 
 		 441 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 		 447 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  20.68 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  21.37 
 
 		 431 aa  76.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  23.86 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  21.05 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  22.39 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  18.99 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  23.16 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  21.71 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  18.85 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  21.83 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  18.9 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  18.9 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  21.4 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  22.03 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 		 415 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  23.6 
 
 		 416 aa  53.5  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  20.23 
 
 		 419 aa  53.5  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  21.96 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6145  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  28.45 
 
 		 365 aa  43.5  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>