42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2647 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 415 aa  840    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  73.73 
 
 		 415 aa  634    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  74.58 
 
 		 419 aa  628  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  73.85 
 
 		 419 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  70.84 
 
 		 414 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  70.84 
 
 		 415 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  71.08 
 
 		 415 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  70.6 
 
 		 415 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  70.84 
 
 		 415 aa  608  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  73.25 
 
 		 415 aa  608  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  70.19 
 
 		 414 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  68.67 
 
 		 415 aa  594  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  69.16 
 
 		 415 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  68.92 
 
 		 415 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  67.47 
 
 		 415 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  67 
 
 		 416 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  40.62 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 419 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  37.29 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  29.72 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  28.15 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  29.29 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  28.53 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  26.27 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  28.12 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  25.13 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  28.05 
 
 		 446 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  26.17 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  24.25 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  21.28 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  19.86 
 
 		 492 aa  69.7  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  22.86 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  23.74 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  22.76 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 573 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  26.58 
 
 		 223 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.57 
 
 		 2240 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 927 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>