38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000843 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  100 
 
 		 390 aa  777    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  81.79 
 
 		 390 aa  660    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  55.89 
 
 		 392 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  52.26 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  29.29 
 
 		 415 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  29.88 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 415 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  27.89 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 		 415 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  28.18 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  27.89 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  26.98 
 
 		 419 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  27.06 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  27.39 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  24.86 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  26.77 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  25.12 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  24.49 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  25.28 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 3035 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  23.14 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  23.77 
 
 		 446 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.04 
 
 		 676 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  33.77 
 
 		 223 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.45 
 
 		 784 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  21.14 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.12 
 
 		 538 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  25.62 
 
 		 924 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.63 
 
 		 572 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 3560 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>