33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0116 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  801    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  52.26 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  52.31 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  52.05 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  29.72 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 414 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  29.79 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  29.41 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  29.02 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  29.4 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  28.5 
 
 		 419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  29.37 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  27.38 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  24.8 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  24.67 
 
 		 407 aa  86.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  27.11 
 
 		 404 aa  86.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  27.3 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  27.1 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  23.91 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  30.38 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 471 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  22.89 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.49 
 
 		 758 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>