37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3074 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  77.24 
 
 		 415 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  79.24 
 
 		 419 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  79.05 
 
 		 415 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 419 aa  845    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  73.85 
 
 		 415 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  72.88 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  71.88 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  71.36 
 
 		 414 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  70.63 
 
 		 415 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  71.95 
 
 		 415 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  71.95 
 
 		 415 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  71.71 
 
 		 415 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  71.19 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  71.39 
 
 		 415 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  70.73 
 
 		 414 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  65.51 
 
 		 416 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  41.83 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  40.05 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  37.71 
 
 		 431 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  27.38 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  26.5 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  27.06 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  27.48 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  25.52 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  24.3 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  27.05 
 
 		 392 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  27.15 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  23.75 
 
 		 454 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  22.18 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  20.23 
 
 		 492 aa  53.1  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  21.22 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  29.11 
 
 		 223 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2153  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.569131  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  22.18 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>