34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0874 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 510 aa  1027    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  42.47 
 
 		 492 aa  365  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  24.78 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  23.99 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  24.32 
 
 		 404 aa  118  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  26.27 
 
 		 441 aa  114  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 428 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  22.41 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  25.45 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  21.47 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  21.91 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  21.84 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  21.34 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  21.45 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  21.43 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  21.28 
 
 		 415 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  21.19 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  23.42 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  20.25 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  19.94 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 414 aa  67  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  23.05 
 
 		 446 aa  67  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  19.63 
 
 		 415 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  25.65 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  23.45 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  22.18 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  23.65 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  21.73 
 
 		 406 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  26.38 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1019 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  22.26 
 
 		 397 aa  43.5  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>