41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02809 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  100 
 
 		 423 aa  870    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  59.52 
 
 		 419 aa  512  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  44.98 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  40.71 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 415 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  41.19 
 
 		 415 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 		 415 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  40.48 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 414 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  40.71 
 
 		 415 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  43.09 
 
 		 415 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  40.44 
 
 		 415 aa  308  8e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  39.43 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  40.05 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  40.14 
 
 		 415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 		 414 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  41.1 
 
 		 415 aa  299  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  39.24 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  38.57 
 
 		 416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  28.03 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  25.89 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  28 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  26.59 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  25.91 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  29.75 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  26.77 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  25.95 
 
 		 392 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  26.05 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  23.45 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  22.97 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  23.9 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  25.28 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  30 
 
 		 223 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 2240 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2819  hypothetical protein  26.57 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70664  hitchhiker  0.00000273831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.58 
 
 		 746 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>