50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2621 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 415 aa  842    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  78.8 
 
 		 415 aa  678    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  78.12 
 
 		 414 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  77.33 
 
 		 419 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  78.31 
 
 		 415 aa  675    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  80 
 
 		 414 aa  685    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  79.52 
 
 		 415 aa  685    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  77.24 
 
 		 419 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  80.48 
 
 		 415 aa  688    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  80.72 
 
 		 415 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  79.76 
 
 		 415 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  78.31 
 
 		 415 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  79.04 
 
 		 415 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  73.73 
 
 		 415 aa  628  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  72.53 
 
 		 415 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  69.3 
 
 		 416 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  41.65 
 
 		 419 aa  319  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  39.72 
 
 		 431 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  40.14 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  29.02 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  27.89 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  28.53 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  24.51 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  25.43 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  24.6 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  26.04 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  27.61 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  27.58 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  26.01 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  21.47 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  22.03 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 833 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  23.74 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  32.91 
 
 		 223 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  22.26 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  23.51 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  22.18 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  21.63 
 
 		 992 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 602 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2153  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.569131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.1 
 
 		 557 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 		 3035 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 465 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31047  TPR-repeat containing protein  28.03 
 
 		 342 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0237182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>