58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3751 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 431 aa  870    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  44.55 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  45.24 
 
 		 423 aa  359  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  41.75 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  40.88 
 
 		 415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  41.85 
 
 		 414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  43.46 
 
 		 415 aa  306  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  41.26 
 
 		 415 aa  305  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  41.26 
 
 		 415 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  42.04 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  41.78 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  39.72 
 
 		 415 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  39.95 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  39.95 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  38.83 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  39.13 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  38.28 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  37.71 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  28.34 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  24.85 
 
 		 404 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  28.33 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  25.84 
 
 		 441 aa  110  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  25.07 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  24.8 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 447 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  24.86 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  25.41 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  26.1 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  25.45 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  24.32 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  22.8 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  22.73 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 		 833 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  29.76 
 
 		 223 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  23.91 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 687 aa  46.6  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 1090 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 602 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  25.79 
 
 		 1124 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.88 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.89 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.9 
 
 		 576 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 4079 aa  44.3  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.45 
 
 		 782 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 3560 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 750 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.32 
 
 		 1056 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0457  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0295186  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 523 aa  43.1  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 302 aa  43.1  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>