More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2246 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3086  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.53 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2464  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  26.59 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 3145 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1931  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.01 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0417979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2559  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1603  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.01 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0684116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 643 aa  62  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 		 1486 aa  62  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2655  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39911  predicted protein  28.41 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 		 3301 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  30 
 
 		 1077 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  28.33 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2050  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.41 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 864 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.65 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 827 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.5 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  26.46 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.12 
 
 		 661 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.39 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 		 2240 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.69 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.95 
 
 		 626 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 566 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 505 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  36.8 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3941  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 		 586 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.32 
 
 		 764 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0592  TPR repeat-containing pilus assembly protein PilF  28.02 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83159  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.61 
 
 		 585 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.09 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.09 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 657 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 323 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.34 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1005 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 573 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 3172 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 934 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 646 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.04 
 
 		 573 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 		 810 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 792 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.01 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 112 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.84 
 
 		 577 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.84 
 
 		 577 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.34 
 
 		 602 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 1161 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 878 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 534 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 448 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 542 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.19 
 
 		 566 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 808 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  27.84 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1904  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.78 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.19 
 
 		 653 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1550  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.7 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389536  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 375 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.71 
 
 		 780 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0650  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 653 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  28.41 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  28.41 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  28.41 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  31 
 
 		 107 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 596 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  25 
 
 		 302 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.67 
 
 		 863 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2299  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 762 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 635 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.22 
 
 		 884 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  32.26 
 
 		 865 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.14 
 
 		 887 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 635 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.23 
 
 		 466 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>