35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2284 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 112 aa  223  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  68.63 
 
 		 104 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  66.67 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  64.71 
 
 		 105 aa  129  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  62.75 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  61.62 
 
 		 102 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  65 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  59.8 
 
 		 104 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  59.8 
 
 		 104 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  60.61 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  50.96 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  52.88 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  58 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  44.76 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  34.31 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 252 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 873 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01282  glutamine-rich cytoplasmic protein (Eurofung)  27.4 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  29.49 
 
 		 260 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 		 436 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 208 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  27.55 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0226  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 322 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 3301 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  38.3 
 
 		 561 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 2262 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 284 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 410 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2575  TPR domain-containing protein  36.96 
 
 		 451 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000631564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>