24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2621 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
107 aa  214  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  58.49 
 
 
111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  52.88 
 
 
107 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  50.94 
 
 
110 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  46.6 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  44.76 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  47.57 
 
 
105 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  45.63 
 
 
104 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  46.53 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  46.53 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  45 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  46.53 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  46.53 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  45.1 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  45.63 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  36.73 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
402 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  30.39 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 
2240 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.07 
 
 
733 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
291 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
405 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>