51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3254 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  206  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  44.79 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  40.21 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  39.8 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  39.6 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  38.54 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  38.54 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  39.13 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  37.37 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1358  hypothetical protein  30.93 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
645 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1514  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1239  hypothetical protein  30.77 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292653  normal  0.0234659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
4079 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
587 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  30.85 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  30.11 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  33.78 
 
 
725 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  36.76 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 
886 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.95 
 
 
274 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0714  hypothetical protein  31.03 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
274 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  27.47 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.95 
 
 
274 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  41.67 
 
 
287 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
827 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  32.91 
 
 
411 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
593 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
274 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.84 
 
 
616 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0206  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
345 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  31.4 
 
 
977 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 
293 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  28.21 
 
 
690 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
690 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
740 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  35.9 
 
 
584 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.3 
 
 
576 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 
637 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 
638 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
860 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.38 
 
 
622 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 
632 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
464 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>