53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2575 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2575  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 451 aa  919    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000631564  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.46 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.84 
 
 		 573 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  23.75 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1027  hypothetical protein  24.53 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000719629  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0906  hypothetical protein  24.53 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  30.77 
 
 		 1230 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  28.14 
 
 		 648 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.45 
 
 		 645 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 800 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  22.49 
 
 		 729 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 		 3301 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.4 
 
 		 647 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  22.25 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  54.55 
 
 		 499 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 744 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 548 aa  49.3  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 591 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.26 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 547 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  18.85 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  26.29 
 
 		 1267 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 582 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  54.55 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 586 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 3172 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 201 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000134059  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  23.88 
 
 		 1339 aa  47  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 109 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 		 3590 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.57 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  22.07 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.6 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  36.84 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 955 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  52 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 266 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 632 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  21.37 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 		 577 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.79 
 
 		 1486 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  23.29 
 
 		 391 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0363  DNA repair protein RadA  48.15 
 
 		 465 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  46.67 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 285 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 		 479 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000170755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  21.89 
 
 		 509 aa  43.1  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>