24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4712 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  56 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  58.1 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  58 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  55.45 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  52.43 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  53.47 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  48.08 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  48.51 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  48.08 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  45.54 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  48.51 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  44.76 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  43.81 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  45.63 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  39.62 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01282  glutamine-rich cytoplasmic protein (Eurofung)  36.14 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2050  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  38.1 
 
 		 258 aa  40.8  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 		 1121 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 708 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 714 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 461 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>