82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0023 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  64.15 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  62.75 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  58.49 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  55.45 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  53.47 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  55 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  50.96 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  53 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  52.48 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  50.98 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  52.53 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  52.53 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  52.53 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  52.53 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  43.69 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  45.54 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  37.93 
 
 		 3301 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  32.98 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 1212 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 291 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 1061 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  31.67 
 
 		 682 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.96 
 
 		 864 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  31.65 
 
 		 436 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  27.66 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  34.48 
 
 		 676 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 1737 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 878 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.17 
 
 		 810 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  34.72 
 
 		 575 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 486 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 589 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  31.08 
 
 		 561 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 351 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  38.89 
 
 		 764 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 824 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01282  glutamine-rich cytoplasmic protein (Eurofung)  41.54 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  38.89 
 
 		 622 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  31.31 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 652 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  30.65 
 
 		 955 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 260 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  35 
 
 		 887 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 243 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 235 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  36.47 
 
 		 246 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1430  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.33 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.14258  normal  0.202712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  39.66 
 
 		 576 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 1049 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 1450 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 461 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  37.5 
 
 		 699 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 289 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 		 557 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35663  predicted protein  31.03 
 
 		 502 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00548899  normal  0.928712 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06138  Protein bimA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17885]  33.33 
 
 		 642 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.112787  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 927 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  31.51 
 
 		 524 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  31.51 
 
 		 494 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  35.29 
 
 		 487 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  35.29 
 
 		 487 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 		 487 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  34.12 
 
 		 652 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  25.32 
 
 		 623 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  35.29 
 
 		 487 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  35.29 
 
 		 487 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  35.29 
 
 		 487 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  35.29 
 
 		 487 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 		 487 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 652 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 416 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  35.29 
 
 		 487 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 4079 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.48 
 
 		 1677 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 566 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>